אלרגן, חומר (אנטיגן) הגורם לעוררות יתר של מערכת החיסון (אלרגיה, תגובה אלרגית) באדם או בבעלי חיים. חדירת האלרגן לגוף היא עפי"ר דרך מערכת הנשימה או באמצעות מזון.
חומרים רבים בסביבה עלולים לעורר תגובה אלרגית בהם - פירות ים, אבקת פרחים, תוספי מזון, תרופות, סוגים של מזונות שונים, סוגי משקאות וכד'.
בשל הרגישות הספציפית של אנשים שונים ותגובות אינדיבדואליות לחומרים שונים, לא ניתן להרכיב רשימה של החומרים האלרגנים.
חלק מסוגי המזון, כגון בוטנים, אגוזים ופירות ים שונים ידועים כמעוררי תגובה אלרגית (אלרגנים) אצל אנשים רבים, זמן התגובה החיסונית של הגוף לאלרגנים משתנה, בין אדם לאדם.
אלרגנים נפוצים נוספים הם העוקץ של הדבורה ופניצילין.