המנגנון המתאר את היווצרות החלבונים במרק הבראשיתי לוקה במעט שכן החלבונים הם מולקולות מורכבות ביותר, תנאי הסביבה של המרק הבראשיתי היו עויינים למדי ליציבות החלבונים שכן הם היו חשופים לפירוק על ידי המים והן בשל החשיפה לקרינה האולטרה סגולה. תרחיש "כתם השמן" מציע פתרון כלשהו לבעיה זו. - לפי סברה זו הכיל הים הקדמוני חומרים שומניים הנוטים ליצור בועות. בתוך הבועות, לפי ההצעה נוצרו החלבונים כך שהם מוגנים הן מהקרינה והן מהמים המאיימים לפרקם ובכך נוצר מצע נוח להתפתחות מולקולות מורכבות דיין הנדרשות לכל אורגניזם חי.